По завршувањето на активното судење, продолжува како контролор на судење на натпревари во организација на УЕФА и ФИФА.
Во рамки на ФФМ, Емил Божиновски, одреден период беше претседател на Судиската комисија, одговорен за организацијата и развојот на судиите, како и за спроведување на стручни семинари и воведување на нови технологии. Sportmanija
Судел на натпревари од Лигата на шампионите, Лига Европа и квалификации за големи натпреварувања.
По завршувањето на активното судење, продолжува како контролор на судење на натпревари во организација на УЕФА и ФИФА. Sportmanija